دو سال قبل بود که ابلاغیه‌ای از سوی معاون وقت ابتدایی وزیر آموزش و پرورش مبنی بر تدریس درس قرآن توسط معلم پایه ابلاغ شد، حال با گذشت دو سال از این مسئله گزارش‌هایی مبنی بر تخطی از آن دریافت شده است. به گزارش خبرگزاری بین‌المللی قرآن(ایکنا)، معاونت آموزش ابتدایی وزارت آموزش و پرورش بر اساس دستورالعمل ساماندهی نیروی انسانی که بخشی از آن به تدریس مدیران و معاونین اشاره داشته است سال ۹۳  اطلاعیه‌ای را مبنی بر لزوم تدریس درس قرآن دوره ابتدایی توسط معلم پایه منتشر و به استان‌ها ابلاغ کرده بود.
ابلاغیه‌ای که اعلام کرده بود درس قرآن در دوره ابتدایی باید توسط معلم پایه تدریس شود، ضمن اینکه در همان ابلاغیه تأکید شده بود که مدیران و معاونان مدارس و حتی مربیان پرورشی مدارس نباید به تدریس درس قرآن برای دوره ابتدایی بپردازند.
از این ابلاغیه دو سال می‌گذرد،‌ اما همچنان مربی پرورشی، مدیر و معاون مدرسه نیز درس قرآن می دهند... همچنین طبق مصوبه ۶۷۷ شورای عالی آموزش و پرورش و مصوبه ۸۴۴ که آموزگار پایه باید قرآن را تدریس کند به خاطر ابهامی که در دستورالعمل ساماندهی نیروی انسانی وجود دارد این درس در مدارس ابتدایی در هاله ای از ابهام است.
بر همین اساس و به خاطر تقلیل ساعت کاری معلمان بیست سال به بالا، درس قرآن در پایه ابتدایی یا توسط مدیران و معاونان تدریس می‌شود یا مربیان پرورشی که صلاحیت تدریس این درس را ندارند(دبیرانی که از دوران متوسطه به دوره ابتدایی منتقل شدند) آن را تدریس می‌کنند آن هم در حالی که دوره‌های لازم را ندیده‌اند.
این مسئله در بسیاری از استان‌ها از جمله زنجان، گیلان، خوزستان، خراسان جنوبی، قم و ... گزارش شده است.
هر چند که صندلی معاونت ابتدایی وزارت آموزش وپرورش ماه‌هاست خالی است، اما پیشنهاد می‌شود معاونت ابتدایی آموزش و پرورش اطلاعیه قبلی را مجدد به استان‌ها و مدارس ابلاغ کند.