برخي از آياتي كه براساس روايات اسلامي يكي از مصاديق آن امام حسين‌است و به گونه‌اي به امام حسين‌تفسير شده‌اند، عبارتند از:

1.سوره فجر، به خصوص آیات: يا أَيتُهَا النَّفْسُ الْمُطْمَئِنَّةُ(الفجر/27)تو اي روح آرام‌يافته!
ارْجِعِي إِلَى رَبِّكِ رَاضِيةً مَرْضِيةً(الفجر/28)به سوي پروردگارت بازگرد در حالي که هم تو از او خشنودي و هم او از تو خشنود است.
حضرت امام صادق مي‌فرمايد: «سوره فجر را در هر نماز واجب و مستحب بخوانيد كه سوره «حسين‌بن‌علي»‌است‌».( ثواب الاعمال‌، شيخ صدوق‌، ص 123، مطبعة الامير. )

2. سوره اسرأ، آيه 33، كه مي‌فرمايد «مَن قُتِل‌َ مَظْلُومًا فَقَدْ جَعَلْنَا لِوَلِيِّه‌ِي سُلْطَـَنًا ...; كسي كه مظلوم كشته شده براي ولي او سلطه (حق قصاص‌) قرار داديم‌
حضرت امام صادق‌مي‌فرمايد: «اين قسمت از آيه دربارۀ امام حسين(ع)‌نازل گرديده است‌«.( الكافي‌، محمدبن يعقوب كليني‌;، ج 8، ص 255، حديث 364، دارالكتب الاسلامية‌، تهران‌. )

3. بخشي از آيات سوره "دهر" (انسان‌) به اهل‌بيت‌: از جمله امام حسين‌مربوط است و بر اين حقيقت نيز روايات فراواني وجود دارد.( ر.ك‌: تفسير مجمع‌البيان‌، طبرسي‌;، ج 5، ص 404، داراحيأ التراث العربي‌، بيروت‌. )

4. آية مباهله‌; كه در جريان مباهله پيامبر اكرم‌حضرت علي و فاطمه و امام حسن و امام حسين‌: را با خود برد و به همين مناسبت‌، آيه 61، آل عمران نازل شد و مصداق‌، "ابنائنا" امام حسن و امام حسين‌هستند. (ر.ك‌: پيام قرآن‌، آيت‌الله مكارم شيرازي و ديگران‌، ج 9، ص 225 ـ 258، دارالكتب الاسلامية‌، تهران‌. )
همچنين آيه تطهير (احزاب‌، 33) ; آيه مودت (شوري‌، 23) ; آيه 19 تا 22 سوره "الرحمن‌" ; آيه اولي‌الامر(نسأ،59)

5.در اوّل 29 سوره از قرآن حروفي آمده كه به حروف مقطعه مشهورند. اين حروف رمزهايي بين خداوند متعال و پيامبراكرم‌بوده‌، تنها خداوند متعال‌، رسول‌اكرم‌و ائمه اطهار: از حقيقت آن اطلاع دارند و دربارة آيه يك سوره مريم (كهيعص‌) روايتي از امام صادق‌آمده است كه مي‌گويد: "كاف‌" اشاره به كربلا، "هأ" به هلاكت‌، "يأ" به يزيد، "عين‌" به عطش و "صاد" به صبر اشاره دارد.( بحارالانوار، علاّمه مجلسي‌، ج 14، ص 664، داراحيأالتراث العربي‌؛تفسير نور الثقلين‌، شيخ عبد علي حويزي‌، ج 3، ص 320، انتشارات اسماعيليان‌)

6. در روايتي ديگر از امام صادق(ع)،‌سال خروج امام حسين(ع)‌با استفاده از حروف مقطعه "الم‌" استخراج شده است‌.(تفسير صافي‌، فيض كاشاني‌، ج 1، ص 134، ذيل آيه 1 سوره بقره‌، دار الكتب الاسلاميه‌)

7. همچنین آياتی مانند:« بِأَي ذَنْبٍ قُتِلَتْ(التکوير/9)به کدامين گناه کشته شدند»؟!
«وَفَدَينَاهُ بِذِبْحٍ عَظِيمٍ(الصافات/107)ما ذبح عظيمي را فداي او کرديم»،و... به شهادت امام حسين‌تأويل شده است‌«.(ر.ك‌: الحسين في القرآن‌، سيدمحمد الواحدي‌، ص 208، 164 و...، نشر لاهيجي‌.)
و...
خلاصه اين كه تمام آياتي كه دربارة اهل‌بيت‌(ع)نازل شده‌، شامل امام‌حسين‌نيز مي‌شود.( ر.ك‌: خصايص الحسينيه‌، شيخ جعفر شوشتري‌، ص 76 ـ 81، دارالكتاب / همگامي امام حسين‌با قرآن‌، حسن دهشيري و...، ص 11 ـ 148. )